Un vaccin à sous-unités ou vaccin sous-unitaire est un vaccin qui contient des parties purifiées d'agents pathogènes qui sont antigéniques ou nécessaires pour induire une réponse immunitaire protectrice. Au contraire d'un vaccin à virus atténué ou à virus inactivé, il ne contient que les parties antigéniques telles que des sous-unités protéiquess, des polysaccharides ou des peptides. Puisqu'il ne contient aucune partie « vivante » de l'agent pathogène, il n'y a aucun risque qu'il introduise la maladie, il est plus sécuritaire et plus stable qu'un vaccin qui contient le pathogène complet. Il présente deux autres avantages : la technologie de production est bien documentée au XXIe siècle et il est efficace pour les personnes immunosupprimée. Sa création, sa production et son inoculation présente des désavantages : la recherche de la bonne combinaison de fragments antigéniques exige du temps, il est plus complexe à fabriquer que certains vaccins à ARN, il peut exiger des adjuvants immunologiques pour augmenter son efficacité et des doses de rappel peuvent être nécessaires pour la même raison.
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