Cet article présente une liste (qui peut ne pas être à jour) d'espèces d'Archées dont le génome a été séquencé.
Liste
| Espèce | Souche | Nombre de paires de bases | Nombre de gènes | Base de données de dépôt | Numéro d'entrée |
|---|---|---|---|---|---|
| Aeropyrum pernix | K1 | 1,669,695 | 2,694 | EMBL/GenBank/DDBJ | AP000058-AP000064 |
| Archaeoglobus fulgidus | DSM4304 | 2,178,400 | 2,436 | GenBank | AE000782 |
| Haloarcula marismortui | ATCC43049 (total) | 4,274,642 (total) | 4242 (total) | GenBank | AY596290–AY596298 |
| Chromosome I | 3,131,724 | AY596298 | |||
| Chromosome II | 288,050 | AY5962907 | |||
| réplicon pNG700 | 410,554 | AY596296 | |||
| réplicon pNG600 | 155,300 | AY596295 | |||
| réplicon pNG500 | 155,300 | AY596294 | |||
| réplicon pNG400 | 155,300 | AY596293 | |||
| réplicon pNG300 | 155,300 | AY596292 | |||
| réplicon pNG200 | 33,452 | AY596291 | |||
| réplicon pNG100 | 33,303 | AY596290 | |||
| Halobacterium species | NRC-1 (chromosome) | 2,014,239 | 2,111 | GenBank | AE004437 |
| NRC-1 (réplicon pNRC100) |
191,346 | 197 | AF016485 | ||
| NRC-1 (réplicon pNRC200) |
365,425 | 374 | AE004438 | ||
| Methanobacterium thermoautotrophicum | delta-H | 1,751,377 | 1,855 | GenBank | AE000666 |
| Methanocaldococcus jannaschii | DSM2661 (1 chromosome circulaire + 1 grand ECE circulaire + 1 petit ECE circulaire) | 1,664,976+58,407+16,550 | 1,738=1682+44+12 | Genome Sequence Database[réf. nécessaire] | L77117, L77118, L77119 |
| Methanococcoides burtonii | DSM 6242 | 2,575,032 | 2,273 | GenBank (autres ?) | CP000300 |
| Methanococcus maripaludis | S2 | 1,661,137 | 1,722 | EMBL/GenBank/DDBJ/ORNL | BX950229 |
| Methanopyrus kandleri | AV19 | 1,694,969 | 1,692 | GenBank | AE009439 |
| Methanosarcina acetivorans | C2A | 5,751,492 | 4,524 | GenBank | AE010299 |
| Methanosarcina barkeri | Fusaro (Chromosome) |
4,837,408 | 3,680 | GenBank/JGI IMG | GenBank:NC_007355 JGI:623520000 |
| Fusaro (Plasmide) |
36,358 | 18 | GenBank:NC_007349 JGI: 623520000 |
||
| Methanosarcina mazei | Goe1 | 4,096,345 | 3,371 | ERGO/GenBank/G2L | GenBank: AE008384 |
| Methanosphaera stadtmanae | DSM3091 | 1,767,403 | 1,534 | EMBL/GenBank/DDBJ | CP000102 |
|
Methanospirillum hungatei
|
JF-1 | 3,544,738 | 3,304 | GenBank | NC_007796 |
| Nanoarchaeum equitans | Kin4M | 490,885 | 552 | EMBL/GenBank/DDBJ | AACL01000000 |
| Natronomonas pharaonis | DSM 2160 (chromosome) |
2,595,221 | 2,675 | EMBL | CR936257 |
| DSM 2160 (réplicon PL131) |
130,989 | 132 | CR936258 | ||
| DSM 2160 (réplicon PL23) |
23,486 | 36 | CR936259 | ||
| Picrophilus torridus | DSM9790 | 1,545,900 | 1,535 | GenBank | AE017261 |
| Pyrobaculum aerophilum | IM2 | 2,222,430 | 2,587 | GenBank | AE009441 |
|
Pyrococcus abyssi
|
GE5 | 1,765,118 | 1,788 | EMBL | AL096836 |
| Pyrococcus furiosus | DSM3638 | 1,908,256 | 2228 | GenBank | AE009950 |
| Pyrococcus horikoshii | OT3 | 1,738,505 | 2,061 | EMBL/GenBank/DDBJ | AP000001-AP000007 |
| Sulfolobus acidocaldarius | DSM639 | 2,225,959 | 2,292 | EMBL/GenBank/Sulfolobus database | GenBank/EMBL:CP000077 |
| Sulfolobus solfataricus | P2 | 2,992,245 | 2,995 | EMBL/GenBank | AE006641 |
| Sulfolobus tokodaii | 7 | 2,694,756 | 2,826 | EMBL/GenBank/DDBJ | AP000981–AP000990 |
| Thermococcus kodakaraensis | KOD1 | 2,088,737 | 2,306 | EMBL/GenBank/DDBJ | AP006878 |
| Thermoplasma acidophilum | DSM1728 | 1,564,905 | 1,509 | EMBL | AL139299 |
| Thermoplasma volcanium | GSS1 | 1,584,799 | 5,321 (mais voir discussion dans l'article source) | GenBank | AP000991–AP000996 |
(en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « List of sequenced archaeal genomes » (voir la liste des auteurs).
Annexes
Articles connexes
- Séquençage de l'ADN
- Projet de séquençage de génome
- Projet microbiome humain
- Liste d'espèces eubactériennes dont le génome est séquencé
- Liste d'espèces protéobacteriennes dont le génome est séquencé
- Liste d'espèces eucaryotes dont le génome est séquencé
- Liste d'espèces d'algues dont le génome est séquencé
- Liste d'espèces de plantes dont le génome est séquencé
Liens externes
- Genome Atlas Database
- SUPERFAMILY Base de données de génomique comparative. Comprend les génomes complètement séquencés de procaryotes, ainsi qu'un outil performant d'exploration et de visualisation des données pour l'analyse.
