Мы используем файлы cookie.
Продолжая использовать сайт, вы даете свое согласие на работу с этими файлами.
Liste d'espèces archéeennes dont le génome est séquencé
Другие языки:

Liste d'espèces archéeennes dont le génome est séquencé

Подписчиков: 0, рейтинг: 0

Cet article présente une liste (qui peut ne pas être à jour) d'espèces d'Archées dont le génome a été séquencé.

Liste

Espèces archéeenes dont le génome est séquencé
Espèce Souche Nombre de paires de bases Nombre de gènes Base de données de dépôt Numéro d'entrée
Aeropyrum pernix K1 1,669,695 2,694 EMBL/GenBank/DDBJ AP000058-AP000064
Archaeoglobus fulgidus DSM4304 2,178,400 2,436 GenBank AE000782
Haloarcula marismortui ATCC43049 (total) 4,274,642 (total) 4242 (total) GenBank AY596290–AY596298
Chromosome I 3,131,724 AY596298
Chromosome II 288,050 AY5962907
réplicon pNG700 410,554 AY596296
réplicon pNG600 155,300 AY596295
réplicon pNG500 155,300 AY596294
réplicon pNG400 155,300 AY596293
réplicon pNG300 155,300 AY596292
réplicon pNG200 33,452 AY596291
réplicon pNG100 33,303 AY596290
Halobacterium species NRC-1 (chromosome) 2,014,239 2,111 GenBank AE004437
NRC-1
(réplicon pNRC100)
191,346 197 AF016485
NRC-1
(réplicon pNRC200)
365,425 374 AE004438
Methanobacterium thermoautotrophicum delta-H 1,751,377 1,855 GenBank AE000666
Methanocaldococcus jannaschii DSM2661 (1 chromosome circulaire + 1 grand ECE circulaire + 1 petit ECE circulaire) 1,664,976+58,407+16,550 1,738=1682+44+12 Genome Sequence Database[réf. nécessaire] L77117, L77118, L77119
Methanococcoides burtonii DSM 6242 2,575,032 2,273 GenBank (autres ?) CP000300
Methanococcus maripaludis S2 1,661,137 1,722 EMBL/GenBank/DDBJ/ORNL BX950229
Methanopyrus kandleri AV19 1,694,969 1,692 GenBank AE009439
Methanosarcina acetivorans C2A 5,751,492 4,524 GenBank AE010299
Methanosarcina barkeri Fusaro
(Chromosome)
4,837,408 3,680 GenBank/JGI IMG GenBank:NC_007355
JGI:623520000
Fusaro
(Plasmide)
36,358 18 GenBank:NC_007349
JGI: 623520000
Methanosarcina mazei Goe1 4,096,345 3,371 ERGO/GenBank/G2L GenBank: AE008384
Methanosphaera stadtmanae DSM3091 1,767,403 1,534 EMBL/GenBank/DDBJ CP000102
Methanospirillum hungatei


(pas de publication)

JF-1 3,544,738 3,304 GenBank NC_007796
Nanoarchaeum equitans Kin4M 490,885 552 EMBL/GenBank/DDBJ AACL01000000
Natronomonas pharaonis DSM 2160
(chromosome)
2,595,221 2,675 EMBL CR936257
DSM 2160
(réplicon PL131)
130,989 132 CR936258
DSM 2160
(réplicon PL23)
23,486 36 CR936259
Picrophilus torridus DSM9790 1,545,900 1,535 GenBank AE017261
Pyrobaculum aerophilum IM2 2,222,430 2,587 GenBank AE009441
Pyrococcus abyssi


(pas de publication)

GE5 1,765,118 1,788 EMBL AL096836
Pyrococcus furiosus DSM3638 1,908,256 2228 GenBank AE009950
Pyrococcus horikoshii OT3 1,738,505 2,061 EMBL/GenBank/DDBJ AP000001-AP000007
Sulfolobus acidocaldarius DSM639 2,225,959 2,292 EMBL/GenBank/Sulfolobus database GenBank/EMBL:CP000077
Sulfolobus solfataricus P2 2,992,245 2,995 EMBL/GenBank AE006641
Sulfolobus tokodaii 7 2,694,756 2,826 EMBL/GenBank/DDBJ AP000981–AP000990
Thermococcus kodakaraensis KOD1 2,088,737 2,306 EMBL/GenBank/DDBJ AP006878
Thermoplasma acidophilum DSM1728 1,564,905 1,509 EMBL AL139299
Thermoplasma volcanium GSS1 1,584,799 5,321 (mais voir discussion dans l'article source) GenBank AP000991–AP000996
(en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « List of sequenced archaeal genomes » (voir la liste des auteurs).

Annexes

Articles connexes

Liens externes

Bibliographie


Новое сообщение